裂解酵母菌的方法是將玻璃微珠和菌細(xì)胞一起渦旋振蕩進(jìn)行機(jī)械破碎。此法充分利用玻璃微珠的快速轉(zhuǎn)動撞擊酵母菌從而機(jī)械破碎裂解酵母細(xì)胞。由此可見,這是一種強(qiáng)有力的裂解方法,但在裂解過程中又傳輸大量的能量,導(dǎo)致樣本的變性。因此,和哺乳動物細(xì)胞的研究比較,酵母菌的免疫沉淀試驗并不是一個好的方法,特別是研究蛋白質(zhì)的性質(zhì)和結(jié)構(gòu)時,該方法是不可取的。
1.準(zhǔn)備工作
由于免疫沉淀有多個步驟,且包括數(shù)小時孵育,因此在實驗開始前必須安排好時間,注意適當(dāng)利用過夜孵育的間隙。這將有助于決定何時開始裂解細(xì)胞。同時應(yīng)注意,
酵母菌免疫沉淀的本底水平非常高,因此推薦進(jìn)行預(yù)處理和使用蛋白酶。
2.所需溶液
PBS,裂解緩沖液(含有蛋白酶抑制劑,置冰上預(yù)冷),玻璃微珠(500umol/L,冷藏)。
3.操作步驟
(1)4000g離心5min收集酵母菌,去上清液。重懸浮于PBS,離心,棄去PBS。
(2)將酵母團(tuán)再次懸浮于少量預(yù)冷的裂解液。通常用大約3倍體積的RIPA緩沖液(150mmol/L NaCl、1%NP-40、0.5%脫氧膽酸鈉、0.1%SDS和50mmol/L Tris,pH8.0)。同時應(yīng)加入蛋白酶抑制劑。置冰上。
(3)玻璃微珠(直徑500~mol/L),用1mol/I鹽酸和裂解緩沖液分別洗滌2次。然后置于少量裂解緩沖液內(nèi),413保存。
(4)在重懸浮的酵母細(xì)胞內(nèi)加入等體積預(yù)冷的玻璃微珠。
(5)劇烈渦流振蕩30s,重復(fù)操作直至大部分酵母細(xì)胞裂解。
(6)將細(xì)胞裂解物連同玻璃微珠以10 000g離心5min。仔細(xì)吸取上清液盛于另一試管,置冰上。
此時,上清液可以用于下一步預(yù)處理。
4.常見問題
該方法常見問題是
蛋白質(zhì)抗原的變性。解決方法是用某些能破壞細(xì)胞壁的酶處理酵母菌使其形成原生質(zhì)體,然后再用去污劑將其裂解。這是一個有效的方法,但酶的價格昂貴,限制了該方法常規(guī)應(yīng)用于大容量標(biāo)本的制備。然而對于所研究的關(guān)鍵蛋白的精細(xì)分析,仍不失為一個有效的方法。